Un biofilm è uno strato dei microorganismi contenuti in una matrice (strato della melma), che si forma sulle superfici in contatto con acqua. L'incorporazione degli agenti patogeni nei biofilm può proteggere gli agenti patogeni da concentrazioni di pesticidi che altrimenti ucciderebbero o inibirebbero quegli organismi sospesi liberamente nell'acqua.

Il biofilm fornisce un porto sicuro per gli organismi come Listeria, E. coli e legionella dove possono riprodursi a livelli in cui la contaminazione dei prodotti che attraversano l'acqua diventa inevitabile.

È stato dimostrato oltre ogni dubbio che il diossido di cloro rimuove il biofilm dai sistemi idrici gli impedisce di formarsi se dosati ad un basso livello continuo. L'ipoclorito d'altra parte si è rivelato avere scarso effetto sui biofilm.

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