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Dans les lacs présentant des couches eutrophiques, il est possible d'avoir des manques en oxygène. Ces conditions anaérobies à la surface des sédiments entraînent des dégagements de phosphate qui permettent aux algues de réaliser la photosynthèse et de produire plus de matière organique. Ce cycle peut être cassé grâce à une aération: l'injection d'air au fond des lacs empêche la stratification et, par conséquent, la détérioration thermique de la qualité de l'eau.

Une alternative, généralement plus chère, est d'éliminer les sédiments, ceci permettant, à la fois d'enlever la source interne de phosphore et aussi d'approfondir le lac.

 

Par le passé, une autre technique expérimentale pour empêcher le développement des nutriments ou pour accélérer leur évacuation, incluait un glaçage du fond des lacs (polyéthylène), un déchargement sélectif de l'eau hypolimnique dans les réservoirs d'eau ou une dilution avec de l'eau d'une source oligotrophique.

Grâce à des expériences en laboratoire et sur le terrain, il a été prouvé que l'argile humidifié s'accrochait aux cellules des algues, entraînant ainsi leur enlisement [7]. Les algues collent aux particules d'argile comme un aimant s'accroche au fer. Quand de l'argile est pulvérisé sur la surface des eaux souillées par des algues nocives,  ces algues dont les cellules sont fixés à l'argile, deviennent chargée de son poids, et tombent au fond des eaux. Dans leur chute, les particules d'algue-argile se heurtent et recueillent plus d'algues, formant ainsi des masses de débris pelucheux appelées neige marine. Aux Etats-Unis, le traitement d'argile n'est pas encore autorisé comme stratégie de traitement pour les algues à fleur d'eau parce qu'il y a encore des doutes au sujet des conséquences écologiques de ce procédé. De nombreuses recherches sont effectuées pour découvrir comment ces débris en chute affectent les organismes des fonds des eaux.

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