Un biofilm est une couche de micro-organismes, contenus dans une matrice solide, se formant sur des surfaces en contact avec de l'eau (illustration de la formation de biofilm à la surface des membranes). L'intégration d'organismes pathogènes dans les biofilms peut les protéger de l'action de biocides, à haute concentration, qui les auraient détruits ou inactivés sans cela.

Les biofilms constituent des refuges sûrs pour les micro-organismes tels que la Legionella, E. Coli, ou la Listéria, où ils peuvent se reproduire à des niveaux suffisants pour aboutir à la contamination de l'eau.

Il a été prouvé que le dioxyde de chlore détruit les biofilms dans les systèmes de transport d'eau, et prévient également leur formation, lorsque celui-ci est utilisé de façon continue à de faibles concentrations. Au contraire, il a été montré que l'eau de Javel n'a que peu d'effet sur les biofilms.

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